Εξ ορισμού δεν έχουν κάποια διασύνδεση με την αποχετευτική μοίρα του νεφρού και δεν περιέχουν ουρά, αντίθετα το περιεχόμενο τους ειναι συνήθως διαυγές και αποτελεί υπέρδιήθημα πλάσματος.

Το μέγεθος τους ποικίλλει από μερικά χιλιοστά έως αρκετά εκατοστά και ειναι οι μεγαλύτερες κύστεις που μπορεί να προκαλέσουν συμπτώματα όπως πόνο ή πίεση στην περιοχή των νεφρών, ή αίσθημα πληρότητας ή βάρους στην κοιλιά. 

Οι νεφρικές κύστεις αναλόγως με την πολυπλοκότητα τους, όπως αυτή απεικονίζεται στην αξονική τομογραφία κε σκιαγραφικό, ταξινομούνται σύμφωνα με το σύστημα ταξινόμησης κατά Bosniak. Το σύστημα Bosniak ταξινομεί τις νεφρικές κύστεις σε κύστεις I-II-IIF-III-IV κατά Bosniak, όπου οι κύστεις I και II  έχουν 0% πιθανότητα για καρκίνο, οι κύστεις IIF έχουν 5-6% πιθανότητα και απαιτούν παρακολούθηση για τουλάχιστον 5 έτη, ενώ οι κύστεις III και IV κατά Bosniak είναι κατά πάσα πιθανότητα κακοήθεις και απαιτούν χειρουργική αφαίρεση, κατά κανόνα με ρομποτική μερική νεφρεκτομή.